结算管理系统替代了我们国内医药行业管理软件的手工台账，由传统手工操作改变成通过系统管理。减少人为差错， 减少工作量，方便公司管理者通过系统查询；从协议到应收应付款项的整体追踪，便于财务在做相关国内医药行业管理软件【有据可查】。结算管理系统主要由三大模块组成：返利协议管理、应收返利管理、应付返利管理。返利协议管理：1. 协议登记：当购货单位打款给供货单位后登记。登记时确定供货单位、购货单位、购货单位的付款方式、协议结束日期、部门、业务员。

国内医药行业管理软件多指应用在药品、医疗器械、设备、中药饮片等相关方面的应用软件管理系统。与其他物流一样，医药行业管理软件系统有着固定的流通性，但在医药产品中，受医药行业资深特质的要求，对医药产品的保存、流通、交易有着严格要求。在当前使用的计算机网络管理中，其主要由系统维护、日常业务、仓库、财务等四个部分组成，系统维护主要负责医药商品的种类识别、计量单位、生产厂家等一系列系统库的建立及数据维护，同时对系统使用部门、人员权限进行控制。

在现实的国内医药行业管理软件中，我们常常听说有发错货、发串货的情况发生。究其原因，这其中难免有保管人员粗心大意的主观成分，而主要的、客观的因素应该是货位与标识不清。打个比方，我们指定了一个仓管员去某个货位取货，如果说他走错了货位，拿错了东西，这完全是人为因素造成的。可是现在的医药流通企业的药品仓储不但货区货架多而且是多人多环节协同工作，如果没有货位与标识的管理，就会降低工作效率，工作效率低下会造成焦虑情绪，从而增加工作差错，由此，不难看出货位与标识在国内医药行业管理软件中重要性。

医药行业管理软件传统的经营模式就是“业务员跑单+内勤接单”，随着医药电商趋势的形成，不掌握电商的运营套路，未来在销售成本、人力成本、管理效率等将落后。很多医药批发企业，想要做好电商运营，但苦于不了解电商运营的岗位配置、流程配合，无法把电商运营做好。国内医药行业管理软件作为一个医药行业管理软件系统，已经提供了很多工具给到电商运营人员，但如果没有去使用好这些运营工具，电商系统的作用将发挥不出来。