国内医药行业管理软件多指应用在药品、医疗器械、设备、中药饮片等相关方面的应用软件管理系统。与其他物流一样，医药行业管理软件系统有着固定的流通性，但在医药产品中，受医药行业资深特质的要求，对医药产品的保存、流通、交易有着严格要求。在当前使用的计算机网络管理中，其主要由系统维护、日常业务、仓库、财务等四个部分组成，系统维护主要负责医药商品的种类识别、计量单位、生产厂家等一系列系统库的建立及数据维护，同时对系统使用部门、人员权限进行控制。

国内医药行业管理软件很重要的的特点就是要：操作简单。考虑很多小型企业的操作人员可能电脑水平都不高，软件操作越简单越好，简单到一看到就知道怎么用。其次才说国内医药行业管理软件的功能，一般企业管理该要的管理功能都是要的，所谓麻雀虽小，五脏俱全。比如：业务方面：采购、销售（批发/零售）、仓库（即所谓进销存）管理，财务方面：应收应付账款管理，资金费用现金银行管理，甚至财务总账凭证报表。虽然公司规模不大，但是流程环节也是一环也不能少。

国内医药行业管理软件已经成了医药批发企业的标配。传统医药批发公司上自建B2B电商平台的几个误区：误区一、把线下的业务做法原封不动照搬到线上。误区二、上了电商后，线上客服（理念、做法）跟不上。误区三、只是做促销，但又没有对促销效果、客户行为进行仔细分析。由于对线上运营的本质理解不透，就像马云说的“看不懂”，导致国内医药行业管理软件上线后的销售额、客单价没有根本上的提升。

医药行业管理软件系统解决方案可解决实际工作中的问题：在中国，开具销项税发票需要使用税务局指定的航天金税防伪税控开票系统（简称：金税系统），而企业所使用的ERP管理软件系统和金税系统相互独立，两者间缺少有效的数据共享接口，造成开票流程涉及大量的手工重复工作和多系统间的数据人工传递。同时，由于医药行业管理软件系统通常没有办法直接接收金税系统返回的发票信息，导致已开具的发票往往难以核查，销售与财务的报表数据常常对应不上，从而影响整个企业的业务管理流程。

医药行业管理软件传统的经营模式就是“业务员跑单+内勤接单”，随着医药电商趋势的形成，不掌握电商的运营套路，未来在销售成本、人力成本、管理效率等将落后。很多医药批发企业，想要做好电商运营，但苦于不了解电商运营的岗位配置、流程配合，无法把电商运营做好。国内医药行业管理软件作为一个医药行业管理软件系统，已经提供了很多工具给到电商运营人员，但如果没有去使用好这些运营工具，电商系统的作用将发挥不出来。