第三方医疗器械管理软件系统是指在药品供应链框架下建立的、具有相对完整的服务内容的专业平台。以社会服务为导向，以信息技术为基础，以现代物流设施与设备基于药物完善的保障体系为核心，为药品的生产、经营企业和医疗单位提供综合服务。目前社会物流企业开展第三方医疗器械管理软件系统业务仍需取得GSP证书，同时药监局、商务部、交通部对于药品运输和使用环节还存在着监管盲区，随着实践的深入，相关政策会陆续出台。第三方医药物流企业需要密切关政策变化，做到合法合规运行。

专业医疗器械管理软件要看这一款软件产品是否具备集成、开放及二次开发能力，是相当重要的！但是，很多中小企业管理者很容易忽略掉这个问题。有些中小企业在选购管理软件时，通常只考虑现在的需求，或者追求价格低廉，像这种情况，就需要求软件具有扩展性，并且要专业医疗器械管理软件开发商具备二次开发能力。这样，企业以后有新需求时，只需根据新需求再开发新的管理模块，然后与现有的管理软件进行无缝结合即可；又或者，企业购买了其他品牌的其他功能模块，要能够与现有的品牌管理软件相结合，这就要求现有的管理软件具备兼容性和开放性。

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中成药、西药的养护主要是要求检查专业医疗器械管理软件，防止不适当的温湿度环境下储存，注意近效期药品的过期情况。按药品包装、说明书上的储存要求进行储存现在按SDA的批准文号管理，中成药是Z，西药是H，生物制品是S;非药品没有“药准字” 部分以前生产的药品文号上不能区别是中药还是西药，只能按其成份来识别，这部分药品目前很少专业医疗器械管理软件是保证药品在库合格的一个重要环节，如果不做好养护工作，可能有很多药品在有效期内就失效，那就导致不确定的用药不安全因素，所以要做好养护工作。